בנם של חנה ומשה אמזלג. נולד ביום י"ג בתשרי תשי"א (24.9.1950) בקזבלנקה במרוקו, ולו שלושה אחים ושמונה אחיות.
בהיותו בן שלוש שנים, עלה עם בני משפחתו ארצה והם התיישבו במושב תפרח שבדרום הארץ.
ניסים גדל והתחנך במושב תפרח, השתלב במסגרות החינוך באזור מגוריו. עם תום לימודיו בבית ספר יסודי, המשיך ללימודים תיכוניים בישיבת "יד בנימין", ובהמשך השתלב בלימודים ב"מכללה הטכנולוגית של חיל האוויר" (הטכני). נער סקרן וחרוץ, אשר כבר מילדות הפגין אהבה ללימודים ונהנה להרחיב ידיעותיו במגוון נושאים.
הבית בו גדל היה מלא באהבה ובערכים, והוא חלק קשר טוב עם בני משפחתו.
בהגיעו לגיל גיוס, התגייס לצה"ל והוצב לשירות בחיל האוויר. חייל מקצועי ומסור, חדור מוטיבציה לשירות משמעותי מתוך תחושת שליחות. סיים קורס קצינים והוצב לשירות בבסיס חצרים. במסגרת שירותו לקח חלק משמעותי בפיתוח ובקידום טכנולוגיות מסווגות, ואף פיקד על גף מערכות. נחשב מפקד מקצועי ומוערך אשר העמיד את טובת המדינה, חבריו ופקודיו לפני טובתו האישית.
ניסים הרחיב את השכלתו בתחום עיסוקו והחזיק בתעודת הנדסאי אלקטרוניקה מטעם "אוניברסיטת תל אביב". היטיב לשלב ידע טכנולוגי מעמיק עם מחויבות אין- סופית לביטחון המדינה.
לצד בניית קריירה צבאית ענפה, הקים משפחה עם מימי אהובתו. השניים חלקו זוגיות חמה ואוהבת, ולאורך השנים נולדו להם שבעה ילדים. "ניסים היה קודם כל איש משפחה" תיארו אותו אוהביו, "הקרין חום ואהבה על כל סובביו - הוריו, אחיו, אחייניו, רעייתו וילדיו. הקים בית חם ומלא באור. היווה עמוד תווך למשפחתו, דמות של נתינה, דאגה ולב ענק שתמיד מצא את הדרך להושיט יד ולעזור".
במהלך שירותו הצבאי נפגע במערכת העצבים ונשאר עם פגיעה גופנית משמעותית. אופיו החזק ורוחו הבלתי מנוצחת סייעו לו בהתמודדותו עם מצבו הבריאותי באופטימיות ותוך ראיית הטוב. הוא המשיך למלא את תפקידיו נאמנה, ועמד איתן אל מול האתגרים שהחיים הציבו בפניו.
לאחר שחרורו משירות צבאי, בדרגת רב-סרן, הקדיש את חייו למשפחתו, ללימוד תורה ולעשייה ציבורית.
ברבות השנים, הפך לסב גאה לתשעה-עשר נכדים והוקיר את הזמן המשותף במחיצתם, רואה במשפחתו המורחבת זכות ומתנה יקרת ערך.
ניסים אלמוג נפטר ביום ט"ז בחשוון תשפ"ה (17.11.2024). בן שבעים וארבע בפטירתו. הובא למנוחות בבית העלמין במושב גילת. הותיר אחריו אישה וילדים, נכדים ונינה, אחים ואחיות.
ספדו לו אוהביו: "דמותו, אישיותו המיוחדת ומורשתו יישארו חקוקים בליבם של כל מי שזכה להכירו".